Genomik Analizler
Referans yeniden dizileme ve De Novo dizileme seçenekleriyle insan, hayvan, bitki ve mikrobiyal genomların kapsamlı analizi.
Tüm Genom Dizileme (WGS / Resequencing)
İnsan Tüm Genom Dizileme
Referans genoma karşı yüksek kapsama derinliğinde insan genomu resequencing analizi. SNP, InDel, CNV ve yapısal varyant tespitinde kullanılır. Popülasyon genetiği, hastalık ilişkilendirme ve farmakogenomik çalışmalar için idealdir.
Hayvan ve Bitki Tüm Genom Dizileme
Model ve model olmayan organizmalar için referans bazlı yeniden dizileme. Islah programları, evrimsel genetik ve QTL haritalama çalışmalarında tercih edilir. Mikrobiyal Tüm Genom DizilemeBakteri ve arke genomlarının hızlı ve ekonomik resequencing analizi. Epidemiyolojik izleme, direnç gen tespiti ve suş karşılaştırması için uygundur.
De Novo Dizileme
Mikrobiyal De Novo Dizileme; Referans genomu bulunmayan bakteri ve arkelerin sıfırdan genomik montajı. Yeni tür karakterizasyonu ve pan-genom analizlerinde kullanılır.
Hayvan ve Bitki De Novo Dizileme; Büyük ve kompleks ökaryot genomlarının kromozom düzeyinde montajı. PacBio ve Oxford Nanopore platformlarıyla uzun okuma desteği sağlanır.
Target Capture Sequencing
İnsan Tüm Ekzom Dizileme (WES); Protein kodlayan bölgelerin (~1-2% genomun) hedefli zenginleştirme ve dizilenmesi. Nadir hastalık tanısı, tümör somatik mutasyon ve klinik araştırmalarda maliyet etkin seçenek.
Tüm Plazmid Dizileme
Rekombinant plazmid yapılarının tam uzunlukta doğrulanması ve karakterizasyonu. Klonlama doğrulama, vektör haritalaması ve sentetik biyoloji uygulamaları için.
SLAF-Seq (Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing)
SLAF-Seq, indirgenmiş temsil genomu dizileme (RRGS) yaklaşımına dayanan, yüksek verimli ve özelleştirilebilir bir genetik markör keşif yöntemidir. Restriksiyon enzimleriyle kesilen DNA'dan 400–500 bç uzunluğundaki SLAF etiketleri üretilerek genomun tekrarlayan bölgelerinden kaçınılır ve markörler eşit dağılımlı biçimde elde edilir. Referans genom
gerektirmeksizin de uygulanabilen bu yöntem; genetik haritalama, GWAS ve evrimsel genetik çalışmalarında geniş örneklem popülasyonlarıyla maliyet etkin analizler sunar.
Başlıca uygulama alanları:
- Genetik Bağlantı Haritası Oluşturma: 2 ebeveyn ve 150+ döl ile QTL haritalama
- Genom Genelinde İlişkilendirme Analizi (GWAS): 200+ örnek ile SNP tabanlı ilişkilendirme
- Evrimsel Genetik: Alt grup başına 10+ örnek içeren popülasyon analizleri
- Referanssız çalışmalar: Örnek kümeleme ve SNP keşfi
- Biyoinformatik analiz hizmetleri
Servis Hizmetlerimiz İçin Bizlere Buradan Ulaşabilirsiniz.